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借助做市制度和协议转让制度，券商正以机构持股身份在新三板公司中逐渐沉淀下来。
制度的不同给券商提供了相对低成本介入新三板公司股权的历史性机遇，也赋予新三板与A股不一样的基因，股权结构的不同就是其中之一。
在新三板公司与A股的股东集中度、股东身份比例等多处股东结构的不同中，一个显著的区别在于，A股公司股东中，基金、社保、保险资金和投资机构等占据主导机构地位，而在新三板公司中，券商成为了相对单一和最主流的机构。
犀牛之星移动APP客户端（www.ipo3.com）统计数据显示，2015年，78家券商沉淀在新三板公司中，东方证券以持有61家公司的股份共1.65亿股位列持股券商第一位，其次，中泰证券持有119家公司的1.39亿股，广发证券持有85家公司的7785万股股份位列第三。
那么券商库存股的成本和盈利状况如何？
在最新的《全国股转系统挂牌公司分层方案(征求意见稿)》中明确提出三个参照标准，它们分别是，标准一为净利润+净资产收益率+股东人数，标准二为营业收入复合增长率+营业收入+股本，标准三为市值+股东权益+做市商家数。
标准中将股东人数和做市商家数这两个在A股评价标准中并不重要的指标放在突出位置，一语道出新三板的历史沿革和现实需要。
新三板基因与库存股收益
来自中国民间的中小微群体为主的新三板企业，挂牌之初便带有股权集中、股东人数偏少、结构相对单一的基因。
经过新三板的快速扩容，当前新三板公司的股东结构以券商、公司股东、投资机构、自然人股东为主要构成，券商成为主流持股机构。
犀牛之星移动APP客户端(www.ipo3.com)统计数据显示，2015年，78家券商一共持有2311家公司的股份19.55亿股。其中，东方证券持有61家公司共1.65亿股位列第一，中泰证券持有119家公司1.39亿股为第二，广发证券持有85家公司的7785万股位列第三。
由于流动性限制和不设涨跌停限制，券商库存股的收益率有一半出现亏损，收益率最高的达到10倍有余。
数据显示，财通证券和东吴证券持有意欧斯各70万股和30万股最高，达1100.8%，其次是广州证券持有温迪数字10万股，收益率1057.14%，兴业证券和中信证券持有阿拉丁10万和40万股，收益率达896.67%，天风证券、长江证券持有易科势腾40万股和20万股，收益率837.04%，东兴证券、国海证券和中银国际证券持有天信投资60万股、10万股、10万股盈利率521.02%。
此外1倍收益以上的个股418笔次持股，50%-100%收益的368笔次，10%到50%笔次的798笔次。而亏损持股达1145笔次。
库存股来源与行业属性
对于众多挂牌公司而言，新三板是一种华丽的存在。由于定增审批简约，通过挂牌和定增，挂牌公司非常简单就可以实现融资，甚至反复融资。除了遵守相关规定，他们唯一需要抱的“大腿”就是券商。
理论上，挂牌公司会选择具有主办券商业务资格、注重新三板业务能力、有核心业务团队和项目经验，且与律所、会计师事务所、评估机构保持良好合作关系的券商。因此，主观和客观上都有形成战略合作的需要。新三板挂牌企业数量在2015年一年内增长三倍，做市企业占比，也由年初8%升至20%，达到1000多家。
券商持股多来自做市和定增，定增途径比重偏高。2015年新三板发布定增预案达3800次，实施定增2400多次，募集资金超过1200亿元，数量超过了创业板一年的定增募资额。定增市盈率中枢呈逐步抬升趋势。由于绝大部分定增都有明确投向，券商参与做市，更具备预判能力，与短期爆发性成长能力相比，做市商对企业长期持续经营能力以及企业规避风险的能力更为看重。
然而，新三板以流动性极低为特色。全国股转系统统计数据显示，新三板有2895家公司在2015年度无交易记录，约占截至2015年底挂牌企业总数5129家的56.4%。
因此，虽然券商持股比例相对偏高，却带有“僵尸股”特性。
另一组数据显示，券商对新三板2311家公司持股中，行业特征呈现出与新兴行业高度相关的特征。持股占比最高的三个行业分别是，软件服务行业465家，占比20.12%，材料行业公司328家，占比14.19%，技术硬件与设备295家，占比12.76%。
有研究表明，信息技术的做市率达25%，高于其他挂牌企业集中的行业。做市商因看好信息技术产业的创新性和成长性而乐于为其做市，也会相应考虑到该行业轻资产的特征而降低对企业规模的要求。
流动性与券商策略
定向增发是做市商获得库存股的主要方式。与买卖价差相比，新三板做市商在定向增发上所获得的溢价收入要可观得多。
然而对券商而言，收益率高也依然有无奈。“股价涨得高，盈利率高其实对券商而言几乎没有现实意义，因为卖不出来。” 券商资深人士表示。券商沉淀在新三板公司中，即便只是几十万到几百万卖出，便能立刻形成砸盘效应，造成市场中股价的剧烈波动。
“统计数据只能反应现在券商的持股状况，但这个对于流动性严重缺失的市场而言是失真或无效的。所以，即便没有亏损也很难受，定增股过了锁定期同样面临要卖的问题。”这位人士继续说。
从流动性分析，券商库存股赚取交易性盈利的心理倾向不明显，因为整体成本偏低，整个券商股的持股市值与其主流业务相比偏小，加上市场中有相当部分不太激进的策略人士，即便分层制度推出对股权结构会造成一定影响，从挂牌公司角度分析，融资到位就已经达成了部分目标，更何况估值得到提升。流动性受限下，市值管理的需求并没有土壤。
由此，长期持股成为了券商主动和被动的选择。
券商2015年新三板库存股持股数据
